Es el órgano supremo de gobierno de la Cofradía. Lo componen todos los hermanos-as de número y bienhechores con mayoría de edad. Se celebran dos de carácter ordinario al año, uno en Noviembre en el que la Junta presenta el Presupuesto para el año siguiente, el plan de actuaciones, la renovación de cargos; y otro en Marzo en que se explica el estado de cuentas del año anterior para su aprobación, se ratifica la entrada de nuevos hermanos y se hace un repaso de los actos penitenciales a celebrar en Semana Santa.

Además se pueden celebrar capítulos extraordinarios monotemáticos convocados por la Junta de Gobierno o por una quinta parte del censo de hermanos con voz y voto.